Stargate SG-1 (Phần 3) thật sự đẩy đội của O'Neill lên trước những kẻ thù đáng sợ nhất trong Đế chế Goauld không ngừng nghỉ. Phần lớn thời gian của mùa phim này, SG-1 phải đối mặt trực diện với Sokar, một Chúa tể Hệ thống cổ xưa, tàn bạo và có phần được xem là "ác quỷ" ngay cả trong giới thống trị Goauld. Sự xuất hiện đầy ghê rợn của hắn được khắc họa rõ nét trong tập kinh điển "The Devil You Know". Sokar không chỉ là một mối đe dọa thông thường; hắn xây dựng cả một "thiên đường địa ngục" mang tên Ne'tu, nơi tra tấn và tâm lý là vũ khí chính. Việc hắn bắt cóc và thí nghiệm tra tấn Jacob Carter/Carters – người thừa kế của Selmak – đã đẩy SG-1 vào tình thế cực kỳ căng thẳng, thách thức mọi giới hạn về lòng dũng cảm và sự kiên trì của họ. Cuộc chiến chống Sokar không đơn thuần là chiến đấu bằng vũ khí, mà còn là cuộc chiến tinh thần, một cuộc đối đầu với nỗi hãi hãi tột cùng. Tuy nhiên, cái chết đáng chú ý của Sokar trong chính tập phim "The Devil You Know" hóa lại lại là một cơ hội, nhưng là cơ hội cho kẻ thù khác còn nguy hiểm hơn. Đó không phải là sự tan rã của mối đe dọa, mà là sự trỗi dậy mãnh liệt của Apophis. Là một trong những Chúa tể Hệ thống hùng mạnh và không khoan nhượng nhất, Apophis vừa mất đi quyền lực trong phần trước, đã nhanh chóng lợi dụng sự hỗn loạn và cái chết của Sokar để lật đổ kẻ thừa kế chính thức của hắn là Heru-ur (con trai của Ra). Trong cảnh phim đầy bất ngờ ngay cuối tập "The Devil You Know", Apophis, nhờ đến một điệp viên tham lam trong hàng ngũ của chính Sokar, đã lần nữa giành lại quyền lực và quyền kiểm soát hạm đội tàu mẹ khổng lồ của Sokar. Đây thực sự là một cú sốc, một bước ngoặt khiến kẻ thù của SG-1 bây giờ trở nên cực kỳ nguy hiểm hơn nữa. Vì vậy, phần sau của Stargate SG-1 (Phần 3) chứng kiến đội của O'Neill chuyển hướng sang đối mặt trực tiếp với Apophis đã hồi sinh và mạnh hơn. Apophis, với lòng căm thù SG-1 đến tận xương tủy, với một hạm đội phi thường vừa chiếm đoạt, và với tham vọng thống trị tuyệt đối, là một đối thủ không đội trời chung. Mối đe dọa của Apophis bao trùm lên Stargate SG-1 (Phần 3), tạo nên một cao trào căng thẳng triền miên. Nghe mà chán nản! Đó là một mùa phim nơi SG-1 liên tục phải đối mặt với cái bóng死亡的 của những kẻ thống trị hắc ám nhất vũ trụ, đôi khi phải chiến đấu theo những cách rất khó đoán, như trong tập "Point of View" hay "100 Days", tất cả đều diễn ra trong bối cảnh áp lực khổng lồ từ Apophis đang ở đỉnh cao quyền lực. Cái chết của Sokar đã không giải quyết được vấn đề; nó chỉ đơn giản tạo ra một mối đe dọa khác nhưng vẫn còn đáng gấp nhiều lần, khiến cuộc sống của đội SG-1 trở thành một cuộc chạy đua sinh tồn không hồi kết. Stargate SG-1 (Phần 3) chắc chắn là một trong những phần kịch tính và đáng sợ nhất của loạt phim, đặc biệt trong giai đoạn chuyển giao quyền lực đáng sợ giữa Sokar và Apophis.