Món Quà Của Cha xoay quanh cuộc đời ông Nhân (Võ Hoài Nam), một người đàn ông lam lũ ở vùng quê sông nước miền Tây. Ông làm nghề đóng quan tài và vớt những xác người chết đuối trôi sông, công việc nặng nhọc, đầy mùi tử khí mà ít ai muốn đụng đến. Một mình ông gồng gánh nuôi ba đứa con khôn lớn: anh cả Trọng Nghĩa (Tuấn Tú), cô em giữa Diệu Thảo (Nguyễn Ngọc Huyền) và thằng út Trọng Hiếu (Lưu Duy Khánh). Thời gian trôi, Trọng Nghĩa lấy vợ sinh con, lập nghiệp riêng; Diệu Thảo theo đuổi đam mê, đang học năm cuối chuyên ngành thanh nhạc ở thành phố lớn; còn ông Nhân vẫn bám víu quê nhà, sống bên thằng út Trọng Hiếu.
Đời ông Nhân gắn với những đêm thức trắng bên sông, những chiếc quan tài ông tỉ mỉ đóng bằng đôi tay chai sạn, và những giọt nước mắt lén lau khi nghĩ về tương lai các con. Nhưng các đứa trẻ lớn lên trong nghèo khó, đôi lúc chúng giận dỗi, trách ông sao cứ bám riết nghề nghiệp ghê rợn ấy, sao không tìm cách đổi đời cho khá hơn. Trọng Nghĩa từng cãi vã kịch liệt vì xấu hổ với vợ con về nghề của cha; Diệu Thảo bươn chải thành phố, gọi về nhà đôi phen trách ông keo kiệt không gửi tiền hỗ trợ giấc mơ ca hát; Hiếu thì nổi loạn tuổi trẻ, bỏ nhà theo bạn bè, để ông cô đơn bên những chiếc bè cũ kỹ.
Rồi cuộc sống quật ngã từng đứa một. Trọng Nghĩa gặp tai ương gia đình, Diệu Thảo vấp ngã giữa Sài Gòn hoa lệ với những thất bại liên miên, Hiếu lang thang trở về sau bao lần sa cơ. Giữa những đổ vỡ ấy, họ lần lượt nhìn lại hành trình cha đã đi qua: những bữa cơm đạm bạc cha nhịn để con ăn no, những khoản tiền cha lén gom góp gửi lên phố, và nỗi đau thầm lặng khi chứng kiến cha một mình đối mặt tử thần trên sông. Đó là món quà lớn lao nhất – tình yêu thương vô bờ, hy sinh thầm lặng chẳng màng đền đáp. Qua bao gian nan, ba anh em nhận ra giá trị thực sự của người cha, ôm ấp ông bằng sự trân trọng muộn màng, biến những vết thương cũ thành sợi chỉ đỏ nối kết gia đình.